MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	GGTG	2	8	29526	29533	0 %	25 %	75 %	0 %	222106157
502	NC_011988	ACC	2	6	29542	29547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106157
503	NC_011988	TG	3	6	29567	29572	0 %	50 %	50 %	0 %	222106157
504	NC_011988	TCC	2	6	29681	29686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106157
505	NC_011988	AT	3	6	29691	29696	50 %	50 %	0 %	0 %	222106157
506	NC_011988	CGC	2	6	29722	29727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106157
507	NC_011988	GC	3	6	29765	29770	0 %	0 %	50 %	50 %	222106157
508	NC_011988	CGA	2	6	29782	29787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106157
509	NC_011988	GCG	2	6	29845	29850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106157
510	NC_011988	TGA	2	6	29917	29922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106157
511	NC_011988	GCT	2	6	29982	29987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106158
512	NC_011988	TGA	2	6	30065	30070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106158
513	NC_011988	GAT	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106158
514	NC_011988	GGC	2	6	30131	30136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106158
515	NC_011988	CCA	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106158
516	NC_011988	TCACG	2	10	30218	30227	20 %	20 %	20 %	40 %	222106158
517	NC_011988	GT	3	6	30430	30435	0 %	50 %	50 %	0 %	222106159
518	NC_011988	AGA	2	6	30515	30520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106159
519	NC_011988	TTG	2	6	30577	30582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106159
520	NC_011988	AAT	2	6	30603	30608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106159
521	NC_011988	CGGT	2	8	30625	30632	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
522	NC_011988	TC	3	6	30635	30640	0 %	50 %	0 %	50 %	222106159
523	NC_011988	GAA	2	6	30705	30710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106159
524	NC_011988	TTG	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106159
525	NC_011988	TCG	2	6	30751	30756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
526	NC_011988	CGG	2	6	30761	30766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
527	NC_011988	GTCG	2	8	30951	30958	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
528	NC_011988	AC	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	222106159
529	NC_011988	CGC	2	6	30978	30983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106159
530	NC_011988	CGC	2	6	31037	31042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106159
531	NC_011988	GCT	2	6	31091	31096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
532	NC_011988	GCG	2	6	31172	31177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
533	NC_011988	CGA	2	6	31249	31254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
534	NC_011988	ACC	2	6	31257	31262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106159
535	NC_011988	AGC	2	6	31295	31300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
536	NC_011988	CTG	2	6	31317	31322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106159
537	NC_011988	GGC	2	6	31327	31332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106159
538	NC_011988	CATCAC	2	12	31346	31357	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222106159
539	NC_011988	CAG	2	6	31379	31384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106159
540	NC_011988	CAC	2	6	31533	31538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
541	NC_011988	GCG	2	6	31544	31549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
542	NC_011988	CCA	2	6	31598	31603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
543	NC_011988	C	6	6	31726	31731	0 %	0 %	0 %	100 %	222106160
544	NC_011988	GGT	2	6	31830	31835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106160
545	NC_011988	GCC	2	6	31896	31901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106160
546	NC_011988	TGGCGA	2	12	31937	31948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222106160
547	NC_011988	GAT	2	6	31971	31976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106160
548	NC_011988	GGC	3	9	32016	32024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
549	NC_011988	GTCCG	2	10	32079	32088	0 %	20 %	40 %	40 %	222106160
550	NC_011988	TGG	2	6	32090	32095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106160
551	NC_011988	GAT	3	9	32181	32189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106160
552	NC_011988	GGC	2	6	32289	32294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106160
553	NC_011988	CCA	2	6	32326	32331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
554	NC_011988	CCAG	2	8	32344	32351	25 %	0 %	25 %	50 %	222106160
555	NC_011988	AAC	2	6	32352	32357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106160
556	NC_011988	GTCC	2	8	32396	32403	0 %	25 %	25 %	50 %	222106160
557	NC_011988	ACC	2	6	32434	32439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106160
558	NC_011988	ATCGG	2	10	32455	32464	20 %	20 %	40 %	20 %	222106160
559	NC_011988	CCG	2	6	32477	32482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106160
560	NC_011988	TTGC	2	8	32504	32511	0 %	50 %	25 %	25 %	222106160
561	NC_011988	TTG	2	6	32573	32578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106161
562	NC_011988	GCC	2	6	32601	32606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106161
563	NC_011988	GCC	2	6	32626	32631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106161
564	NC_011988	CAG	2	6	32663	32668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106161
565	NC_011988	CTG	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106161
566	NC_011988	AAT	2	6	32744	32749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106161
567	NC_011988	ATC	2	6	32757	32762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106161
568	NC_011988	TGG	3	9	32794	32802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106161
569	NC_011988	CTGGC	2	10	32853	32862	0 %	20 %	40 %	40 %	222106161
570	NC_011988	AGC	2	6	32883	32888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106161
571	NC_011988	CGCC	2	8	32890	32897	0 %	0 %	25 %	75 %	222106161
572	NC_011988	GCG	2	6	32901	32906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106161
573	NC_011988	GCG	2	6	32942	32947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106161
574	NC_011988	GCG	2	6	32967	32972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106161
575	NC_011988	GT	3	6	33016	33021	0 %	50 %	50 %	0 %	222106161
576	NC_011988	ACC	2	6	33135	33140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106161
577	NC_011988	AGGC	2	8	33299	33306	25 %	0 %	50 %	25 %	222106161
578	NC_011988	GGC	2	6	33401	33406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106161
579	NC_011988	GAT	2	6	33422	33427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106161
580	NC_011988	ACA	2	6	33496	33501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106161
581	NC_011988	GCA	2	6	33541	33546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106161
582	NC_011988	GCTCG	2	10	33583	33592	0 %	20 %	40 %	40 %	222106161
583	NC_011988	GCG	2	6	33670	33675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106162
584	NC_011988	TGT	2	6	33687	33692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106162
585	NC_011988	CT	3	6	33711	33716	0 %	50 %	0 %	50 %	222106162
586	NC_011988	TTC	2	6	33768	33773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106162
587	NC_011988	GATA	2	8	33833	33840	50 %	25 %	25 %	0 %	222106162
588	NC_011988	CCA	2	6	33884	33889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106162
589	NC_011988	GCCA	2	8	33907	33914	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
590	NC_011988	CAC	2	6	33921	33926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106162
591	NC_011988	GTTG	2	8	33935	33942	0 %	50 %	50 %	0 %	222106162
592	NC_011988	CCG	2	6	33943	33948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106162
593	NC_011988	CG	4	8	33995	34002	0 %	0 %	50 %	50 %	222106162
594	NC_011988	GAAAG	2	10	34043	34052	60 %	0 %	40 %	0 %	222106162
595	NC_011988	CGG	2	6	34057	34062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106162
596	NC_011988	GGC	2	6	34068	34073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106162
597	NC_011988	CGAC	2	8	34115	34122	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
598	NC_011988	TCT	2	6	34123	34128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106162
599	NC_011988	CAAT	2	8	34142	34149	50 %	25 %	0 %	25 %	222106162
600	NC_011988	CGAC	2	8	34249	34256	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
601	NC_011988	CCG	2	6	34376	34381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106162
602	NC_011988	CGA	2	6	34421	34426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106162
603	NC_011988	GTC	2	6	34450	34455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106162
604	NC_011988	CCAA	2	8	34474	34481	50 %	0 %	0 %	50 %	222106162
605	NC_011988	ATC	2	6	34552	34557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106162
606	NC_011988	CGC	2	6	34562	34567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106162
607	NC_011988	TGC	2	6	34587	34592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106162
608	NC_011988	TCA	2	6	34609	34614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106162
609	NC_011988	CCAGCA	2	12	34640	34651	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222106162
610	NC_011988	CGA	2	6	34748	34753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106162
611	NC_011988	CGG	2	6	34766	34771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106162
612	NC_011988	GTTT	2	8	34783	34790	0 %	75 %	25 %	0 %	222106162
613	NC_011988	TGA	2	6	34879	34884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106162
614	NC_011988	TGG	2	6	34917	34922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106162
615	NC_011988	CGAG	2	8	35060	35067	25 %	0 %	50 %	25 %	222106162
616	NC_011988	GC	3	6	35080	35085	0 %	0 %	50 %	50 %	222106162
617	NC_011988	CCG	2	6	35089	35094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106162
618	NC_011988	AGT	2	6	35122	35127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106162
619	NC_011988	TCG	2	6	35131	35136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106162
620	NC_011988	GCG	2	6	36775	36780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106163
621	NC_011988	GT	3	6	36789	36794	0 %	50 %	50 %	0 %	222106163
622	NC_011988	CGC	2	6	36799	36804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106163
623	NC_011988	GCA	2	6	36819	36824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106163
624	NC_011988	CTT	2	6	36884	36889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106163
625	NC_011988	GAAAG	2	10	36899	36908	60 %	0 %	40 %	0 %	222106163
626	NC_011988	CGT	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106163
627	NC_011988	GAC	2	6	36935	36940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106163
628	NC_011988	TGA	2	6	36951	36956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106163
629	NC_011988	T	6	6	36966	36971	0 %	100 %	0 %	0 %	222106163
630	NC_011988	CCT	2	6	37867	37872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106164
631	NC_011988	TGGA	2	8	37879	37886	25 %	25 %	50 %	0 %	222106164
632	NC_011988	ATG	2	6	37918	37923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106164
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643	NC_011988	GC	3	6	38569	38574	0 %	0 %	50 %	50 %	222106164
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650	NC_011988	GCA	2	6	39143	39148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106165
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652	NC_011988	CTG	2	6	39285	39290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106165
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662	NC_011988	TGG	2	6	39727	39732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106165
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753	NC_011988	CCG	2	6	45042	45047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106170
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